El Instituto de Investigación Hispano Luso de Investigaciones Agrarias, de carácter multidisciplinar, se concibe para impulsar la investigación básica y aplicada en disciplinas relacionadas con la agricultura, fundamentalmente la biotecnología, biología molecular y genómica aplicadas a las plantas cultivadas y a las interacciones de las mismas con microorganismos patógenos y beneficiosos, así como los procesos hidrológicos del suelo y el estudio y conservación de germoplasma vegetal.
 
En este ámbito, los objetivos operativos del Instituto de Investigación Hispano Luso de Investigaciones Agrarias don fomentar la investigación en los grupos adscritos al Instituto mediante la adquisición de infraestructuras científicas y el incremento de recursos humanos (investigadores y técnicos) para apoyar su trabajo; fortalecer las relaciones entre los grupos mediante la consecución de proyectos y contratos de investigación competitivos conjuntos, la participación en redes multidisciplinares con temática agrícola y la cooperación con organismos de investigación de alto nivel; captar nuevos grupos de investigación que hayan acreditado su calidad en líneas de investigación estratégicas para el Instituto; fomentar la transferencia de tecnología a la sociedad mediante contratos para la realización de estudios y servicios, y el desarrollo y explotación de patentes; establecer convenios de colaboración con otros centros e instituciones para el establecimiento de colaboraciones científicas y la formación de personal; y consolidar la oferta de formación especializada: Máster y Programa de Doctorado en Agrobiotecnología, e incrementar la oferta de cursos y estancias en el Instituto para la formación específica.
 
Por su parte, el Instituto Multidisciplinar de Empresa se ha creado para desarrollar las capacidades de las personas y organizaciones empresariales y para fortalecer su contribución al desarrollo económico. Sus objetivos operativos son promover la internacionalización de la investigación, originar alianzas con organismos de investigación de alto nivel, colaborar con las empresas trasladándoles sus conocimientos, estimular la participación de los investigadores en actividades relacionadas con el mundo de la empresa, favorecer la participación de los investigadores en cursos de formación para investigadores, suscitar la participación de los investigadores sénior en la dirección y supervisión de la investigación de los investigadores junior, ofertar formación especializada a través de cursos de formación específica de conocimientos apoyados en los resultados de la investigación, establecer incentivos para los investigadores sénior y junior y facilitar la participación y la gestión de proyectos de investigación competitivos.
 
La creación de ambos institutos cuenta con el informe favorable de la Agencia para la Calidad del Sistema Universitario de Castilla y León (Acsucyl). Asimismo, esta institución considera como fortalezas del Instituto de Investigación Hispano Luso de Investigaciones Agrarias el hecho de que posea buenas infraestructuras, la capacidad demostrada para obtener recursos que le permitan llevar a cabo su actividad, el promedio de producción científica de sus miembros y la existencia de programas de máster y doctorado consolidados y de buena calidad. En este mismo sentido, Acsucyl también valora positivamente la multidisciplinariedad del Instituto Multidisciplinar de Empresa, sus líneas de investigación, la actividad científica del conjunto de los proponentes y su capacidad de transferir conocimiento.

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